Das Cologne Institute for Information Systems (CIIS) der Universität zu Köln forscht interdisziplinär an der Schnittstelle von Wirtschaftsinformatik, künstlicher Intelligenz und realweltlichen Anwendungsdomänen. Im Rahmen einer neuen Forschungsinitiative zu AI-driven Protein Design wird am Lehrstuhl von Prof. Dr. Detlef Schoder eine Stelle als Doctoral Researcher / Research Assistant in AI-driven Protein Design (f/m/x) ausgeschrieben.
Die Stelle umfasst insbesondere die Entwicklung und Erweiterung ML-basierter Protein-Design-Pipelines zur Vorhersage und Optimierung von Bindungsverhalten in Protein-Protein-Interaktionskontexten, die Optimierung von Proteinbindern für definierte biologische Targets, die Integration physics-informed scoring functions in ML-Pipelines sowie die Entwicklung und Evaluation hybrider Scoring-Frameworks auf Basis experimenteller und in-silico-Daten. Darüber hinaus ist die Teilnahme an internationalen Protein-Design-Benchmarks und Wettbewerben vorgesehen.
Gesucht werden Bewerber*innen mit einem Masterabschluss in Bioinformatik, Computational Biology, Informatik, Wirtschaftsinformatik oder einem verwandten Fach. Besonders willkommen sind Erfahrungen in Structural Biology / Protein Modeling, Computational Chemistry oder Biophysics sowie im Bereich generativer Modelle oder Representation Learning. Erwartet werden solide Programmierkenntnisse, Kenntnisse im Bereich Machine Learning sowie sehr gute Englischkenntnisse.
Die Stelle ist ab dem 1. Juni 2026 in Teilzeit mit 27,88 Wochenstunden zu besetzen und bis zum 31. März 2028 befristet. Die Vergütung erfolgt bei Vorliegen der persönlichen und tariflichen Voraussetzungen nach EG 13 TV-L.